إختارته الهيئة الدولية العالمية الكوميسا الأول على علماء المسلمين من بين 500 عالم من دول العالم الإسلامي كما حصل على وسام الدولة للعلوم والفنون سنة 1977.
قام بإنشاء مؤسسة أحمد شفيق للعلوم وهي مؤسسة خيرية لعلاج المحتاجين من المرضى يطلقون عليها في الخارج اسم مجموعة شفيق جروب.
كما أنشأ العديد من العيادات في مختلف الأحياء الشعبية لعلاج الفقراء وغير القادرين.

توفي يوم الخميس 1 نوفمبر 2007 عن عمر يناهز 73 عاما إثر ازمة قلبية. شيعت جنازته بعد ظهر الأحد من جامع عمر مكرم بوسط القاهرة ووصل جثمانه إلى القاهرة الأحد وكان على رأس المشيعين العميد أسامة النحاس والدكتور سامح فريد عميد كلية طب القصر العيني وعدد كبير من كبار الأساتذة والأطباء وأسرة الفقيد وقد دفن شفيق في مسقط رأسه بالمنوفية.